La Capilla de San José, ubicada en una de las naves del Santuario de la Salud y la Paz, la iglesia del Padre Eustáquio, ha sido restaurada. Ahora cuenta con un altar dedicado exclusivamente al santo. La restauración no requirió obras, solo la reorganización de algunas imágenes que anteriormente se exhibían en la capilla.
Desde la colocación de la primera piedra de la iglesia, el Padre Eustáquio soñó con construir una capilla interior para San José. Al construirse la iglesia, el espacio se destinó a este fin. Sin embargo, con el tiempo, la esencia de la Capilla de San José se perdió.
El cambio forma parte de un proceso de recuperación de las raíces del Santuario de Salud y Paz. Esto se debe a que, antes de morir, el Beato Padre Eustace dejó escritos que detallaban cómo quería que se construyera la iglesia.