Desde que llegó a Água Suja/MG en 1925, el Padre Eustáquio dedicó su trabajo misionero al cuidado del alma y del cuerpo de los residentes locales.
Como el pueblo carecía de médicos, el padre Eustáquio usaba ramas y remedios naturales caseros para ayudar a los enfermos del pueblo. Incluso recibía medicinas caseras de Holanda para usarlas en su labor misionera.
El Padre Jerónimo Roozen acompañó la labor del Beato con los enfermos de Água Suja. En su testimonio ante el Tribunal de la Causa de Beatificación y Canonización del Padre Eustáquio, en 1964, habló de un momento en que tuvo que sustituir al Beato:
“"Una vez, estando él ausente y yo siendo su sustituto, fui a ver a un paciente suyo que sufría de asma y problemas del corazón; el paciente me contó que el Padre Eustaquio le daba ciertas pastillas; teniendo pastillas de menta en casa, le administré esta medicina, y el paciente después me dijo que se sentía mejor, pero que la medicina que le dio el Padre Eustaquio era mejor que la mía."”